Сюжет фильма разворачивается в первом веке нашей эры и рассказывает о Гае Юлии Цезаре Августе Германике, известном как Калигула. Он вступает в борьбу за трон Римской империи, стремясь избавиться от своего дяди Тиберия, который уже стар и не может долго править. Калигула, одержимый страхом потерять власть, начинает жестокую расправу над своими врагами и союзниками.

После того как Тиберий погибает, Калигула становится императором. Его правление характеризуется безумными реформами, развратом и жестокостью. Он издает популистские законы и ведет разгульную жизнь, что приводит к недовольству среди сенаторов и знати. Вскоре его прежние союзники начинают строить заговор против него.

Важной частью сюжета является его инцестуозная любовь к сестре Юлии Друзилле, которая умирает незадолго до его собственного убийства. В финале Калигула становится жертвой заговора, организованного теми, кого он когда-то считал близкими. После его смерти на трон восходит Клавдий, дядя Калигулы, который представлен как трусливый и слабоумный правитель.

В городе Энск иностранный контрабандист Карбофос похищает из зоопарка редкого полосатого слона по кличке Балдахин, который ранее сбежал от него из-за плохого обращения. Знаменитые братья-сыщики берутся за дело. Карбофос пытается вывезти Балдахина за границу, обманным путём получив справку в сувенирном магазине, что фарфоровый слон принадлежит ему. В аэропорту Колобки переманивают Балдахина его любимым рыбьим жиром и игрой на трубе, но злодей пытается вернуть слона музыкой на флейте. Карбофос начинает запихивать Балдахина в самолёт, но Шеф стреляет в табуретку на спине Карбофоса, пытаясь помешать ему. Слуга Карбофоса переходит на сторону сыщиков, обстреливая своего хозяина шариками. Злодей улетает, а братья вместе со слугой и слоном идут по городу.

Мультсериал «Следствие ведут Колобки» был создан режиссёрами Александром Татарским и Игорем Ковалёвым на ТО «Экран». Первая часть вышла в 1986 году, вторая – в 1987 году. В дальнейшем персонажи этого мультфильма братья Пилоты Шеф и Коллега активно используются студией «Пилот».