В 1519 году в Севилье знаменитый адмирал Фернандо Магеллан решает отправиться в путешествие к экзотическим островам. Он собирает пять кораблей, чтобы избежать столкновения с португальцами. К нему присоединяется молодой смельчак Хуан Элькано, который становится рулевым под командованием капитана Картахены. Цель экспедиции — найти загадочные Острова Пряностей, используя секретную карту Магеллана. По мере продвижения экспедиции команда сталкивается с многочисленными испытаниями, включая штормы и конфликты с другими капитанами. Картахена подбивает остальных на мятеж, обвиняя Магеллана в предательстве. Однако планы мятежников не удаются. Вождь одного из островов просит помощи в битве, и Магеллан соглашается, взамен требуя проводника на Молуккские острова. После убийства Магеллана Элькано становится капитаном и продолжает путь. Команда добирается до Молуккских островов, где наладит торговые отношения с местным королем. Однако португальцы приближаются, и Элькано должен торопиться. Он преодолевает опасный Мыс Штормов и возвращается домой, где его встречает Инес. Из первоначальных 240 человек в живых остаются только 18.

Сюжет начинается с того, что внезапная вспышка света превращает всех людей на Земле в камень. Спустя почти четыре тысячи лет, старшеклассник Тайдзю освобождается из каменной оболочки и обнаруживает, что все вокруг него остаются статуями. Однако он не один: его друг Сэнку, гениальный ученик, также вернулся к жизни. По подсчетам Сэнку, на дворе 5 октября 5738 года. Вместе они решают восстановить цивилизацию и разгадать тайну окаменения. Они используют научные знания, чтобы создать растворитель, который может разрушить каменную оболочку людей. Первым делом они освобождают сильного старшеклассника Цукасу, который становится ключевой фигурой в конфликте между двумя группами: Королевством Науки Сэнку и Могущественной Империей Цукасы. Цукаса убежден, что только подростки и дети заслуживают спасения, что приводит к противостоянию между двумя кланами.